“圣=法利佩号事件”船员的一句话，是秀吉迫害基督教徒的契机吗？──文禄5年（年）圣菲利佩号指的是西班牙的伽利昂船。这个sun=feripe号漂到了日本的四国，以船员和丰臣政权方面的纠纷为契机，秀吉再次发出禁教令，达到迫害天主教的一连串的事是「san=feripe号事件」。天正15年（年）、豊臣秀吉突然，突然瓦特伦放逐令出台禁止基督教传教本来，秀吉就是以前的主君織田信長的政策，允许基督教的传教活动。前一年，他拜见了耶稣会传教士加斯帕尔·科埃利耶，并颁发了传教许可证。
但是，完成征伐九州的秀吉，实际上在筑前国的箱崎逗留，得知长崎实质上已成为耶稣会的领地后，对耶稣会产生威胁的秀吉，把之前的文件交给了葡萄牙的通商负责人·多明戈斯·蒙特伊罗和科利略。在发出“放逐瓦伦令”之前，秀吉承认了“天正十五年六月十八日付觉”。其中写着成为基督教徒是个人的信仰问题，大名不应该强迫领地的农民入教。还记载着大名治理领地只是一时的，有时也会更换领地。与此相对，由于农民没有交替，所以没有必要成为大名的信仰。
另外，他还提到了基督教徒的动向，称他是策略家超过一向宗的信徒。一向宗的信徒由于在寺领设置国群的事避免对领地的大名的年贡，更加放逐领地的大名，一向宗的僧侣替代支配着领地。也就是说，基督教徒也担心会成为一向宗教。放逐瓦特伦令后，由于重视南蛮贸易的实际利益，宣教士们以秀吉默认的形式继续活动。放逐令是禁止传教活动的，基督教的信仰本身并没有被禁止。在这样的情况下，秀吉成为了天下。文禄5年（年）日发生了圣=法利佩号事件。圣=法利佩号事件的内容前往菲律宾马尼拉的圣菲利佩号在东海上遭遇了台风。
砍倒主要桅杆等，船的损伤严重，同年8月28日漂至四国的土佐海域，受到了通知长宗我部元亲被拖到了浦户湾内。船在湾内的沙洲搁浅，传教士和船员们被留在长浜。圣菲利佩号的船长派遣了数名使者到秀吉身边，要求修复船只并保全船只，但秀吉并没有与使者见面，而是代替秀吉奉行。増田長盛被派遣了。长盛根据秀吉的命令，给船员们制作了名单和装货一览表。当时，从都城的葡萄牙人等处听说“西班牙人是海盗，为了武力制压日本而来到测量”的秀吉的文件中，船员们反驳此事，引起了纠纷，最终装货和船员的携带品全部没收。
船员们表示抗议，并做出了“日本也将不久被西班牙征服”的言行，这些事情的经过都报告给了秀吉。紧接其后的12月8日，继天正之后又颁布了禁教令，京都和大阪的传教士们也被捕获。当时，20名日本信徒被捕，共计26人在长崎被处刑。此时的26人，被称为“日本二十六圣人”的人们。再次发出禁教令的理由据说秀吉之所以发出禁教令，是因为害怕基督教势力扩大而引起一向一揆般的叛乱。其他，因为基督教徒迫害了神道和佛教的信徒，伏特加尔人把日本人做为奴隶等，复数的理由被考虑,不过，真相不明白。
其中，直接的契机被认为是耶稣会准管区长、天然气珍珠、高丽的过度言行。他向征伐完九州的秀吉展示了西班牙舰队，并夸示自己是在指挥下的。同时期访问当时的情况的东印度管区巡查师·亚历山大·瓦利尼亚诺留下着，在那个中严厉地避难着koryo的轻率的行动。圣菲利佩号被旧金山会修道士捕获，船员们得到了修复许可。结果，秀吉批准了船舶建设，第二天庆长2年（年）从浦户出发，到达马尼拉事件的经过被西班牙政府报告了。船长的兰地丁等人作为证人被传讯，事件的详细情况被叙述了。此后，作为西班牙使节don·刘易斯·nabarete们从马尼拉被秀吉的原派遣了。当时，要求返还圣菲利佩号的货物，并将被处刑的传教士们的遗体交给秀吉。